MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 3282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004552	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004552	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004552	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004552	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004552	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004552	TAT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004552	ATT	3	9	3072	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004552	TGT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004552	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004552	CAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004552	TTG	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004552	AATC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004552	TTG	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004552	TTCA	2	8	6729	6736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004552	TGTTT	2	10	6759	6768	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004552	ATC	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004552	AAT	2	6	16839	16844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004552	TTA	2	6	16919	16924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004552	A	6	6	16976	16981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004552	AAT	2	6	16996	17001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004552	TAAA	2	8	17012	17019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004552	TTTC	2	8	17669	17676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004552	AG	3	6	17685	17690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004552	GTT	2	6	20311	20316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004552	TCC	2	6	20317	20322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_004552	TCT	2	6	20374	20379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004552	AAT	2	6	20387	20392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004552	TAA	2	6	21710	21715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004552	T	9	9	21757	21765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004552	TAA	2	6	21774	21779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004552	TCT	2	6	23735	23740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004552	T	7	7	23789	23795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004552	TGA	3	9	23830	23838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004552	AAG	2	6	23873	23878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004552	CTT	2	6	23883	23888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004552	ATT	2	6	26521	26526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004552	T	6	6	26525	26530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004552	TATTT	2	10	26539	26548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004552	T	7	7	26564	26570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004552	T	6	6	26579	26584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004552	ATTT	2	8	26627	26634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004552	ATTA	2	8	26638	26645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004552	A	6	6	30298	30303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004552	TTTC	2	8	31610	31617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004552	GA	3	6	31672	31677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004552	T	6	6	31728	31733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004552	CTTA	2	8	31768	31775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_004552	CTT	2	6	31941	31946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004552	TCTA	2	8	32013	32020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_004552	AGG	2	6	32022	32027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004552	A	6	6	32323	32328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004552	TTAAT	2	10	32341	32350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004552	AAT	2	6	32368	32373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004552	TTAA	2	8	32379	32386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004552	TTA	2	6	33389	33394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004552	AAG	2	6	33410	33415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004552	A	7	7	33465	33471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004552	AAG	2	6	33534	33539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004552	TTTAA	2	10	33558	33567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004552	TGG	2	6	34190	34195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004552	ATAAA	2	10	34245	34254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004552	A	6	6	34262	34267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004552	TTC	2	6	37549	37554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004552	TCA	2	6	37614	37619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004552	GCG	2	6	37634	37639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004552	TATGC	3	15	37663	37677	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004552	TC	3	6	37700	37705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_004552	TCAA	2	8	37739	37746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004552	A	6	6	37816	37821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004552	GAC	2	6	37840	37845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004552	TCAA	2	8	37886	37893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004552	AG	4	8	37904	37911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004552	TGTT	2	8	37955	37962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004552	ATAG	2	8	38007	38014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004552	TAT	2	6	38068	38073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004552	GAA	2	6	39444	39449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004552	TTA	2	6	42302	42307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004552	A	7	7	43354	43360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004552	GTT	2	6	43367	43372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004552	TA	3	6	52133	52138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004552	GAT	2	6	52149	52154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004552	TGT	2	6	52184	52189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004552	TCG	2	6	52216	52221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004552	TTG	2	6	52231	52236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004552	T	6	6	52247	52252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004552	TTC	2	6	52254	52259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004552	T	7	7	52282	52288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004552	GTC	2	6	52334	52339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004552	A	6	6	52370	52375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004552	AAG	2	6	52434	52439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004552	CTT	2	6	52491	52496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004552	AAAG	2	8	52529	52536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004552	TTTA	2	8	52539	52546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004552	TACG	2	8	52592	52599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004552	GAAG	2	8	52642	52649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004552	CCT	2	6	52652	52657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_004552	T	7	7	52664	52670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004552	ATTT	2	8	52673	52680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004552	TGC	2	6	52731	52736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004552	CCT	2	6	52737	52742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_004552	TGC	2	6	52743	52748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004552	AGG	2	6	52762	52767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004552	A	6	6	54398	54403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004552	T	7	7	54423	54429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004552	AAT	2	6	54451	54456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004552	GAA	2	6	54717	54722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004552	TGG	2	6	57782	57787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004552	TTAAT	2	10	57886	57895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004552	A	8	8	58021	58028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004552	TCTTT	2	10	59292	59301	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004552	GGC	2	6	59331	59336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004552	GAG	2	6	59390	59395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004552	ATT	2	6	59439	59444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004552	TTA	2	6	59466	59471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004552	A	6	6	59488	59493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004552	TAA	2	6	59540	59545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004552	AGA	2	6	59616	59621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004552	GT	4	8	59773	59780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004552	T	7	7	59780	59786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004552	CTA	2	6	59855	59860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004552	CAA	2	6	63179	63184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004552	TG	3	6	63188	63193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004552	GTT	2	6	64259	64264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004552	A	6	6	64272	64277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004552	AGA	2	6	64287	64292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004552	AAT	2	6	64324	64329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004552	GCTTT	2	10	64430	64439	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004552	CTTT	2	8	64450	64457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_004552	AAT	2	6	64518	64523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004552	GAG	2	6	64529	64534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004552	GCCT	2	8	70065	70072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_004552	TGGT	2	8	70081	70088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004552	GATA	2	8	70101	70108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004552	AG	3	6	70120	70125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004552	GAGGG	2	10	70143	70152	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004552	GTC	2	6	70175	70180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004552	AGA	2	6	70219	70224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004552	T	7	7	70957	70963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004552	A	7	7	71007	71013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004552	CACTT	2	10	71015	71024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_004552	ATAA	2	8	71085	71092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004552	ATA	2	6	71123	71128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004552	TGT	2	6	72013	72018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004552	TTA	3	9	73980	73988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004552	ATC	2	6	75977	75982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_004552	T	6	6	77218	77223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004552	TCA	2	6	77302	77307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_004552	A	6	6	77343	77348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004552	CT	3	6	77370	77375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_004552	TCTCAA	2	12	77458	77469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_004552	TCT	2	6	77476	77481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_004552	TATT	2	8	77561	77568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_004552	T	7	7	77596	77602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_004552	ATTA	2	8	77618	77625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004552	AATT	2	8	77627	77634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_004552	TG	4	8	128288	128295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_004552	TTAA	2	8	128374	128381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_004552	TGT	2	6	128398	128403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_004552	AC	3	6	128421	128426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
284	NC_004552	ACA	2	6	128470	128475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_004552	TAC	2	6	128486	128491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_004552	AT	3	6	130098	130103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_004552	CTT	2	6	130222	130227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_004552	A	6	6	130273	130278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_004552	ATT	2	6	130330	130335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_004552	AGG	2	6	130350	130355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_004552	T	6	6	193709	193714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_004552	T	6	6	193744	193749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_004552	TAA	2	6	195535	195540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_004552	GAA	2	6	195587	195592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_004552	TTA	2	6	196249	196254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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